Вода, переносимая акведуком Агуас Ливрес из Лиссабона, проходила через эмиссарную сеть, состоящую из пяти галерей, в основном подземных, протяженностью около 12 километров.
Аквариум был открыт в 1898 году при поддержке Д. Карлоса I (1863–1908), и его главная цель заключалась в том, чтобы предложить посетителю прямой контакт с великими богатствами водного мира.