Главный зал, который считается старейшим сохранившимся образцом синтоистской архитектуры, был построен в период Хэйан (794–1185) и состоит из трех частей, соединенных в стиле нагарэ-дзукури, с большими святынями слева и справа и меньшей центральной.
Бассейн Ямасиро развивался вокруг реки Кидзугава как процветающее сельскохозяйственное сообщество, поддерживающее и соединяющее древние бывшие столицы Киото и Нара.
Легенда гласит, что храм Фудзиояма Каннондзи был основан в 735 году, когда император Сёму приказал буддийскому монаху увековечить одиннадцатиликого бодхисаттву Каннон, чтобы молиться за безопасное строительство статуи Великого Будды.