Храм Святителя Николая Чудотворца и старинная усадьба расположена в селе Клёново, в 25 км на юг от города Троицка и менее чем 20 км на юго-запад от города Подольска Московской области. В усадьбе Клёново сохранились руины главного дома, второй деревянный этаж здания сгорел в 1992 году. Неплохо сохранился одноэтажный флигель с мезонином рубежа XIX – XX веков, который сейчас занят под жильё, и парк с небольшим количеством старых деревьев. В отличном состоянии находится Церковь Святителя Николая или Петропавловская церковь, построенная в 1793 году, которая также относится к усадебному комплексу. Церковь построена в стиле раннего классицизма. Здание церкви относится к распространённому типу «восьмерик на четверике». Усадьба Клёново и церковь Святителя Николая являются памятниками архитектуры.
По писцовым книгам 1627 – 1628 годов село Кленово, на речке Моча, находилось в Перемышльской волости Московского уезда «за князем Никитою Петровым сыном Барятинского», получившего его в наследство от братьев Михаила и Фёдора, имевшие двор вотчинников, в котором жил приказчик, двор дворового человека, три крестьянских и семь бобыльих дворов. К тому же в селе была деревянная церковь Николая Чудотворца.
Никита Барятинский умер и Клёново перешло к его наследникам. В 1675 году Юрий Никитович продал село князю Степану Васильевичу Ромодановскому. На тот момент в селе уже было 15 крестьянских и 5 бобыльских дворов. В 1681 году село унаследовала его дочь Марфа. Часть своих владений Марфа продала, затем она вышла замуж и Клёново перешло её мужу, Борису Михайловичу Черкасскому. В 1722 году село досталось по наследству их сыну, Петру Борисовичу Черкасскому.
В 1756 году Пётр Борисович Черкасский обратился в Московскую духовную Консисторию с просьбой разрешить ему построить новую деревянную церковь взамен старой. Разрешение было получено и в 1758 году новая деревянная церковь была освящена. А в 1793 году на месте деревянной была выстроена каменная Петропавловская церковь с приделом Святого Николая.
С 1 июля 2012 года село Кленово вместе с усадьбой вошло в состав города федерального значения Москва и находится в Троицком административном округе Москвы. До этого Кленово находилось в составе Подольского района Московской области.
55.3219, 37.348