Заповедник создан для охраны самой северной группировки амурского тигра, нерестилищ ценных лососевых рыб и лесных экосистем северного Приморья во всем их разнообразии. Особый объект охраны - палеонтологический памятник - местонахождение окаменелой верхнетретичной флоры. Флора и фауна заповедника насыщена редкими и эндемичными видами (венерины башмачки крупноцветковый и пятнистый, лимонник китайский, тис остроконечный; из птиц - черный аист, черный журавль, рыбный филин и др.)