Центральный сибирский ботанический сад СО РАН является центром интеграции ботанических и экологических исследований в Сибири. В Институте работают Совет ботанических садов Сибири, Совет по проблемам ботаники Сибири, Совет по особо охраняемым объектам растительного мира, Новосибирское отделение Российского ботанического общества.
В настоящее время созданы и создаются новые экспозиции: "Каменистая горка", "Сад непрерывного цветения" (520 видов), "Бонсай"в открытом грунте (150 выставочных экземпляров) и др. Дендрарий и лесопарк насчитывают 400 видов, 166 форм и гибридов, коллекции кормовых растений - 270 видов, лекарственных и пряно-ароматических растений - 350 видов, редких и исчезающих более 100 видов, декоративных растений - 428 видов, пищевых - 144 вида. В оранжереях представлено более 3000 видов тропических и субтропических растений. Имеется гербарий, насчитывающий 550 тысяч гербарных листов и семенотека, содержащая семена 1220 видов; большая коллекция лишайников и грибов.