Расположен на северо-западном побережье Байкала. Это самая большая природоохранная зона на Байкале (14 место в России). Включает в себя 110 км береговой линии от р. Хейрем до мыса Елохин, участок Байкальского хребта и верховья Лены - великой сибирской реки - с ее притоками. Река Лена по длине (4400 км) занимает первое место в России и десятое в мире . По мысу Елохин проходит граница Иркутской области с Республикой Бурятия. Основная часть территории заповедника - таежные леса различных типов. На побережье Байкала сохранились фрагменты древних реликтовых степей. В заповеднике насчитывается свыше 800 видов растений, 50 видов млекопитающих, около 240 видов птиц.