В заповедник входят пространства Большеземельской тундры на Югорском полуострове, средняя и северная части хребта Пай-Хой, остров Вайгач, Долгий и другие в Баренцевом море. Территория государственного заповедника «Большеземельский» примечательна равнинными, горными и тундровыми ландшафтами, которые хорошо сохранились до наших дней.
Остров Вайгач – отдельная история.
Его второе исконное название – Хэбидя-Я.
Это священный остров ненецкого народа. В древности здесь располагались главные святилища и жертвенные места ненцев. Всего же на острове обнаружено более 200 памятников истории и культуры, среди которых: древние ненецкие святилища, идолы, исторические памятники, которые относятся к промысловой деятельности древних поморов – приметные, обетные и могильные кресты, становища, зимовья, кладбища. Кроме того, туристы могут увидеть здесь свидетельства пребывания на острове первых русских гидрографических экспедиций.