Уникальная экосистема с богатым растительным и животным миром, многие виды которых занесены в Красную книгу. Заповедник создан для охраны природы тайги и высокогорной тундры. Абсолютные высоты заповедника, зани-мающие Чулышманское нагорье, - 2500-3000 м.В 1998 году участок Алтайского заповедника был включен в территорию Всемирного наследия ЮНЕСКО.