Музей расположен в костеле св. Михаила Архангела и отдельных помещениях бывшего монастыря бернардинок, рядом с Бернардинским костелом и костелом св. Анны.
У подножия горы Гедиминаса, возле горы Бекешо и в нескольких шагах от территории замкового резервата расположился центр искусств, приглашающий создавать и открывать искусство в уникальной природной и исторической атмосфере города.