Пещерный храм преподобного Серафима Саровского располагается в здании Келейного корпуса комплекса Свято-Троицкого мужского монастыря. Храм восстановили в 1997 году под Казанским приделом церкви Сергия Радонежского.
Храм Усекновения главы Иоанна Предтечи относится к числу архитектурных памятников федерального значения. Возможно, это древнейший, самый первый храм города Алатыря, заложенный, по преданию, царем Иоанном Васильевичем в 1553 году.
Церковь преподобного Сергия Радонежского располагается в здании Калейного корпуса Свято-Троицкого мужского монастыря. Кирпичная одноглавая трапезная церковь была построена с северной стороны главного Собора Пресвятой Троицы в 1801-1817 годах.
Церковь в честь иконы Божией Матери "Нечаянная Радость" расположена на территории городского кладбища. В 2002 году на месте будущего алтаря был установлен крест.
Церковь Иакова Алфеева относится к числу памятников архитектуры регионального значения. Она располагается на месте деревянной однопрестольной церкви, построенной в 1749 году.